Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX39BQ13838 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX39BQ13838 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX39BQ13838 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX39BQ13838 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX39BQ13838 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX39BQ13838 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX39BQ13838 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX39BQ13838 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX39BQ13838 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX39BQ13838 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX39BQ13838 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX39BQ13838 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX39BQ13838 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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