Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMED1Q13445 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMED1Q13445 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMED1Q13445 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMED1Q13445 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMED1Q13445 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMED1Q13445 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMED1Q13445 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMED1Q13445 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMED1Q13445 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMED1Q13445 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMED1Q13445 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMED1Q13445 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMED1Q13445 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMED1Q13445 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMED1Q13445 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMED1Q13445 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMED1Q13445 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMED1Q13445 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMED1Q13445 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMED1Q13445 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMED1Q13445 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMED1Q13445 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMED1Q13445 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMED1Q13445 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMED1Q13445 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMED1Q13445 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMED1Q13445 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMED1Q13445 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMED1Q13445 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMED1Q13445 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMED1Q13445 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMED1Q13445 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMED1Q13445 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMED1Q13445 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMED1Q13445 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMED1Q13445 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMED1Q13445 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMED1Q13445 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMED1Q13445 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
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