Protein–RNA interactions for Protein: Q06210

GFPT1, Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFPT1Q06210 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GFPT1Q06210 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GFPT1Q06210 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GFPT1Q06210 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GFPT1Q06210 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GFPT1Q06210 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GFPT1Q06210 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GFPT1Q06210 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GFPT1Q06210 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GFPT1Q06210 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GFPT1Q06210 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GFPT1Q06210 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GFPT1Q06210 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GFPT1Q06210 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GFPT1Q06210 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GFPT1Q06210 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GFPT1Q06210 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GFPT1Q06210 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GFPT1Q06210 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GFPT1Q06210 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GFPT1Q06210 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GFPT1Q06210 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GFPT1Q06210 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GFPT1Q06210 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GFPT1Q06210 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GFPT1Q06210 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GFPT1Q06210 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GFPT1Q06210 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GFPT1Q06210 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GFPT1Q06210 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GFPT1Q06210 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GFPT1Q06210 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GFPT1Q06210 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GFPT1Q06210 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GFPT1Q06210 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GFPT1Q06210 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GFPT1Q06210 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GFPT1Q06210 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GFPT1Q06210 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GFPT1Q06210 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GFPT1Q06210 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GFPT1Q06210 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GFPT1Q06210 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GFPT1Q06210 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GFPT1Q06210 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GFPT1Q06210 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GFPT1Q06210 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GFPT1Q06210 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GFPT1Q06210 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GFPT1Q06210 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GFPT1Q06210 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GFPT1Q06210 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GFPT1Q06210 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GFPT1Q06210 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GFPT1Q06210 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms