Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFITM3Q01628 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFITM3Q01628 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFITM3Q01628 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFITM3Q01628 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFITM3Q01628 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFITM3Q01628 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFITM3Q01628 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFITM3Q01628 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFITM3Q01628 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFITM3Q01628 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFITM3Q01628 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFITM3Q01628 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFITM3Q01628 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFITM3Q01628 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFITM3Q01628 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFITM3Q01628 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFITM3Q01628 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFITM3Q01628 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFITM3Q01628 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFITM3Q01628 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFITM3Q01628 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFITM3Q01628 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFITM3Q01628 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFITM3Q01628 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFITM3Q01628 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFITM3Q01628 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFITM3Q01628 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFITM3Q01628 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFITM3Q01628 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFITM3Q01628 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFITM3Q01628 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFITM3Q01628 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFITM3Q01628 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFITM3Q01628 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFITM3Q01628 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFITM3Q01628 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFITM3Q01628 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFITM3Q01628 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFITM3Q01628 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFITM3Q01628 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFITM3Q01628 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFITM3Q01628 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFITM3Q01628 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFITM3Q01628 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFITM3Q01628 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFITM3Q01628 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFITM3Q01628 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFITM3Q01628 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFITM3Q01628 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFITM3Q01628 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFITM3Q01628 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFITM3Q01628 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFITM3Q01628 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFITM3Q01628 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFITM3Q01628 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFITM3Q01628 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFITM3Q01628 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFITM3Q01628 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFITM3Q01628 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFITM3Q01628 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFITM3Q01628 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFITM3Q01628 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFITM3Q01628 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFITM3Q01628 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFITM3Q01628 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFITM3Q01628 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFITM3Q01628 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms