Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSF1Q00613 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSF1Q00613 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HSF1Q00613 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSF1Q00613 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSF1Q00613 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSF1Q00613 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSF1Q00613 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSF1Q00613 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSF1Q00613 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HSF1Q00613 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSF1Q00613 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSF1Q00613 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSF1Q00613 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSF1Q00613 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSF1Q00613 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSF1Q00613 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSF1Q00613 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HSF1Q00613 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HSF1Q00613 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSF1Q00613 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSF1Q00613 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSF1Q00613 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSF1Q00613 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSF1Q00613 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSF1Q00613 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms