Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX1P78414 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX1P78414 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX1P78414 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX1P78414 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX1P78414 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX1P78414 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX1P78414 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX1P78414 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX1P78414 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX1P78414 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX1P78414 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX1P78414 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX1P78414 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX1P78414 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX1P78414 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX1P78414 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX1P78414 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX1P78414 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX1P78414 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX1P78414 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX1P78414 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
IRX1P78414 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX1P78414 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX1P78414 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX1P78414 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX1P78414 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX1P78414 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX1P78414 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX1P78414 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX1P78414 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX1P78414 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX1P78414 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX1P78414 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX1P78414 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX1P78414 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRX1P78414 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX1P78414 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
IRX1P78414 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX1P78414 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX1P78414 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX1P78414 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX1P78414 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX1P78414 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX1P78414 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX1P78414 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX1P78414 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX1P78414 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX1P78414 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX1P78414 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX1P78414 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX1P78414 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX1P78414 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX1P78414 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX1P78414 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX1P78414 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX1P78414 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX1P78414 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX1P78414 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX1P78414 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX1P78414 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX1P78414 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX1P78414 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX1P78414 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX1P78414 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX1P78414 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX1P78414 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX1P78414 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX1P78414 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX1P78414 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX1P78414 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX1P78414 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX1P78414 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX1P78414 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX1P78414 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX1P78414 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX1P78414 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX1P78414 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IRX1P78414 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IRX1P78414 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX1P78414 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX1P78414 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX1P78414 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX1P78414 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX1P78414 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX1P78414 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX1P78414 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX1P78414 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX1P78414 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX1P78414 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX1P78414 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX1P78414 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX1P78414 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX1P78414 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX1P78414 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX1P78414 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX1P78414 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX1P78414 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX1P78414 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX1P78414 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms