Protein–RNA interactions for Protein: P61224

RAP1B, Ras-related protein Rap-1b, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1BP61224 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAP1BP61224 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAP1BP61224 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAP1BP61224 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAP1BP61224 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAP1BP61224 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAP1BP61224 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAP1BP61224 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAP1BP61224 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAP1BP61224 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAP1BP61224 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAP1BP61224 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAP1BP61224 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAP1BP61224 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAP1BP61224 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAP1BP61224 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAP1BP61224 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAP1BP61224 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms