Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCR4P61073 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCR4P61073 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCR4P61073 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCR4P61073 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCR4P61073 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCR4P61073 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCR4P61073 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCR4P61073 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCR4P61073 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCR4P61073 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCR4P61073 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR4P61073 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR4P61073 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR4P61073 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR4P61073 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCR4P61073 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCR4P61073 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR4P61073 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR4P61073 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR4P61073 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR4P61073 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR4P61073 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR4P61073 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCR4P61073 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCR4P61073 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCR4P61073 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXCR4P61073 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR4P61073 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR4P61073 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR4P61073 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR4P61073 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR4P61073 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR4P61073 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR4P61073 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR4P61073 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR4P61073 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR4P61073 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR4P61073 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR4P61073 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR4P61073 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXCR4P61073 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXCR4P61073 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR4P61073 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCR4P61073 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms