Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GSDMDP57764 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GSDMDP57764 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GSDMDP57764 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GSDMDP57764 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GSDMDP57764 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GSDMDP57764 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GSDMDP57764 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GSDMDP57764 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GSDMDP57764 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GSDMDP57764 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GSDMDP57764 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GSDMDP57764 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GSDMDP57764 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GSDMDP57764 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GSDMDP57764 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GSDMDP57764 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GSDMDP57764 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GSDMDP57764 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GSDMDP57764 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GSDMDP57764 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GSDMDP57764 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GSDMDP57764 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GSDMDP57764 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GSDMDP57764 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GSDMDP57764 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GSDMDP57764 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GSDMDP57764 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GSDMDP57764 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GSDMDP57764 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GSDMDP57764 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GSDMDP57764 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GSDMDP57764 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GSDMDP57764 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GSDMDP57764 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GSDMDP57764 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GSDMDP57764 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GSDMDP57764 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GSDMDP57764 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GSDMDP57764 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GSDMDP57764 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GSDMDP57764 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GSDMDP57764 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GSDMDP57764 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GSDMDP57764 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GSDMDP57764 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GSDMDP57764 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GSDMDP57764 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GSDMDP57764 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GSDMDP57764 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GSDMDP57764 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GSDMDP57764 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GSDMDP57764 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GSDMDP57764 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GSDMDP57764 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GSDMDP57764 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GSDMDP57764 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GSDMDP57764 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GSDMDP57764 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GSDMDP57764 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GSDMDP57764 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GSDMDP57764 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GSDMDP57764 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GSDMDP57764 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GSDMDP57764 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GSDMDP57764 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GSDMDP57764 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GSDMDP57764 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GSDMDP57764 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GSDMDP57764 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GSDMDP57764 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
GSDMDP57764 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GSDMDP57764 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GSDMDP57764 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GSDMDP57764 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GSDMDP57764 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GSDMDP57764 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GSDMDP57764 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GSDMDP57764 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GSDMDP57764 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GSDMDP57764 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GSDMDP57764 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GSDMDP57764 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GSDMDP57764 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms