Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCBP4P57723 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PCBP4P57723 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCBP4P57723 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCBP4P57723 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCBP4P57723 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCBP4P57723 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCBP4P57723 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCBP4P57723 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PCBP4P57723 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCBP4P57723 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCBP4P57723 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCBP4P57723 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PCBP4P57723 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCBP4P57723 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCBP4P57723 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCBP4P57723 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCBP4P57723 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCBP4P57723 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCBP4P57723 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PCBP4P57723 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCBP4P57723 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCBP4P57723 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCBP4P57723 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCBP4P57723 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCBP4P57723 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCBP4P57723 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCBP4P57723 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCBP4P57723 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCBP4P57723 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCBP4P57723 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCBP4P57723 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCBP4P57723 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCBP4P57723 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCBP4P57723 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PCBP4P57723 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PCBP4P57723 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCBP4P57723 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCBP4P57723 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms