Protein–RNA interactions for Protein: P54132

BLM, Bloom syndrome protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLMP54132 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
BLMP54132 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
BLMP54132 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.87■■■■□ 3.49
BLMP54132 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
BLMP54132 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
BLMP54132 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
BLMP54132 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
BLMP54132 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
BLMP54132 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
BLMP54132 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
BLMP54132 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
BLMP54132 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
BLMP54132 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
BLMP54132 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
BLMP54132 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
BLMP54132 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
BLMP54132 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
BLMP54132 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
BLMP54132 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
BLMP54132 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
BLMP54132 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
BLMP54132 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
BLMP54132 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
BLMP54132 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.71■■■■□ 3.47
BLMP54132 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
BLMP54132 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BLMP54132 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
BLMP54132 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BLMP54132 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BLMP54132 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
BLMP54132 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
BLMP54132 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
BLMP54132 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
BLMP54132 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BLMP54132 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BLMP54132 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BLMP54132 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
BLMP54132 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
BLMP54132 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
BLMP54132 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
BLMP54132 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
BLMP54132 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
BLMP54132 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
BLMP54132 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
BLMP54132 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
BLMP54132 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
BLMP54132 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
BLMP54132 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BLMP54132 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
BLMP54132 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
BLMP54132 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
BLMP54132 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
BLMP54132 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
BLMP54132 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
BLMP54132 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
BLMP54132 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
BLMP54132 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
BLMP54132 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
BLMP54132 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
BLMP54132 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
BLMP54132 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
BLMP54132 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
BLMP54132 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
BLMP54132 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
BLMP54132 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
BLMP54132 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
BLMP54132 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
BLMP54132 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
BLMP54132 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
BLMP54132 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
BLMP54132 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
BLMP54132 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
BLMP54132 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
BLMP54132 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
BLMP54132 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
BLMP54132 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
BLMP54132 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
BLMP54132 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
BLMP54132 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
BLMP54132 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
BLMP54132 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
BLMP54132 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
BLMP54132 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
BLMP54132 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
BLMP54132 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
BLMP54132 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
BLMP54132 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
BLMP54132 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
BLMP54132 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
BLMP54132 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
BLMP54132 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
BLMP54132 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
BLMP54132 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
BLMP54132 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
BLMP54132 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
BLMP54132 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
BLMP54132 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
BLMP54132 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
BLMP54132 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
BLMP54132 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms