Protein–RNA interactions for Protein: P53816

PLA2G16, HRAS-like suppressor 3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G16P53816 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLA2G16P53816 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLA2G16P53816 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PLA2G16P53816 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLA2G16P53816 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLA2G16P53816 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLA2G16P53816 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLA2G16P53816 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLA2G16P53816 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLA2G16P53816 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PLA2G16P53816 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLA2G16P53816 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLA2G16P53816 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLA2G16P53816 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLA2G16P53816 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLA2G16P53816 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLA2G16P53816 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLA2G16P53816 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLA2G16P53816 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PLA2G16P53816 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLA2G16P53816 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLA2G16P53816 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLA2G16P53816 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLA2G16P53816 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLA2G16P53816 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLA2G16P53816 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLA2G16P53816 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLA2G16P53816 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLA2G16P53816 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLA2G16P53816 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLA2G16P53816 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLA2G16P53816 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLA2G16P53816 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLA2G16P53816 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLA2G16P53816 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLA2G16P53816 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLA2G16P53816 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLA2G16P53816 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms