Protein–RNA interactions for Protein: P53041

PPP5C, Serine/threonine-protein phosphatase 5, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP5CP53041 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP5CP53041 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP5CP53041 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP5CP53041 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP5CP53041 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP5CP53041 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP5CP53041 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP5CP53041 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP5CP53041 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP5CP53041 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP5CP53041 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP5CP53041 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP5CP53041 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP5CP53041 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPP5CP53041 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP5CP53041 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP5CP53041 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP5CP53041 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP5CP53041 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP5CP53041 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP5CP53041 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP5CP53041 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP5CP53041 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP5CP53041 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP5CP53041 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP5CP53041 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP5CP53041 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP5CP53041 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP5CP53041 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP5CP53041 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP5CP53041 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP5CP53041 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP5CP53041 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP5CP53041 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP5CP53041 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP5CP53041 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP5CP53041 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP5CP53041 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP5CP53041 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP5CP53041 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP5CP53041 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP5CP53041 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms