Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD97P48960 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD97P48960 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD97P48960 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD97P48960 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CD97P48960 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD97P48960 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD97P48960 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD97P48960 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD97P48960 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD97P48960 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CD97P48960 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD97P48960 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD97P48960 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD97P48960 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CD97P48960 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CD97P48960 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CD97P48960 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD97P48960 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD97P48960 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD97P48960 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD97P48960 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CD97P48960 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD97P48960 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD97P48960 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD97P48960 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD97P48960 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD97P48960 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD97P48960 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD97P48960 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD97P48960 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD97P48960 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD97P48960 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD97P48960 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD97P48960 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CD97P48960 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD97P48960 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD97P48960 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD97P48960 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD97P48960 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD97P48960 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD97P48960 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD97P48960 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD97P48960 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CD97P48960 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD97P48960 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD97P48960 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD97P48960 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD97P48960 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD97P48960 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD97P48960 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD97P48960 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD97P48960 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD97P48960 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD97P48960 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD97P48960 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD97P48960 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD97P48960 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD97P48960 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD97P48960 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD97P48960 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD97P48960 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD97P48960 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD97P48960 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD97P48960 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD97P48960 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD97P48960 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD97P48960 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CD97P48960 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CD97P48960 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD97P48960 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CD97P48960 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CD97P48960 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD97P48960 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD97P48960 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD97P48960 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD97P48960 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD97P48960 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD97P48960 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD97P48960 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD97P48960 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD97P48960 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD97P48960 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD97P48960 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD97P48960 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD97P48960 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD97P48960 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD97P48960 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD97P48960 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD97P48960 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD97P48960 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD97P48960 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD97P48960 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD97P48960 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD97P48960 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD97P48960 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD97P48960 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD97P48960 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD97P48960 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD97P48960 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms