Protein–RNA interactions for Protein: P42773

CDKN2C, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2CP42773 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN2CP42773 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN2CP42773 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN2CP42773 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN2CP42773 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN2CP42773 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN2CP42773 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN2CP42773 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKN2CP42773 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKN2CP42773 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKN2CP42773 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKN2CP42773 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN2CP42773 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN2CP42773 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN2CP42773 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKN2CP42773 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKN2CP42773 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN2CP42773 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN2CP42773 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN2CP42773 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN2CP42773 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN2CP42773 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN2CP42773 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN2CP42773 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN2CP42773 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDKN2CP42773 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN2CP42773 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN2CP42773 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN2CP42773 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN2CP42773 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKN2CP42773 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKN2CP42773 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKN2CP42773 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2CP42773 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2CP42773 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2CP42773 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2CP42773 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKN2CP42773 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKN2CP42773 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKN2CP42773 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKN2CP42773 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN2CP42773 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN2CP42773 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN2CP42773 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKN2CP42773 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKN2CP42773 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN2CP42773 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN2CP42773 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN2CP42773 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN2CP42773 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN2CP42773 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN2CP42773 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN2CP42773 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN2CP42773 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN2CP42773 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN2CP42773 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN2CP42773 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN2CP42773 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN2CP42773 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN2CP42773 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKN2CP42773 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN2CP42773 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN2CP42773 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN2CP42773 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN2CP42773 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN2CP42773 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN2CP42773 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDKN2CP42773 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKN2CP42773 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKN2CP42773 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKN2CP42773 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKN2CP42773 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKN2CP42773 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKN2CP42773 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN2CP42773 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN2CP42773 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN2CP42773 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN2CP42773 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN2CP42773 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKN2CP42773 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKN2CP42773 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKN2CP42773 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKN2CP42773 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKN2CP42773 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.9 ms