Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIA3P42263 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIA3P42263 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIA3P42263 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA3P42263 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA3P42263 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA3P42263 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA3P42263 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA3P42263 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIA3P42263 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIA3P42263 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIA3P42263 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIA3P42263 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIA3P42263 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIA3P42263 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIA3P42263 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIA3P42263 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIA3P42263 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIA3P42263 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIA3P42263 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIA3P42263 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIA3P42263 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIA3P42263 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIA3P42263 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA3P42263 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA3P42263 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA3P42263 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA3P42263 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA3P42263 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA3P42263 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA3P42263 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIA3P42263 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIA3P42263 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
GRIA3P42263 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRIA3P42263 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms