Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC26A3P40879 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC26A3P40879 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC26A3P40879 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC26A3P40879 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC26A3P40879 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC26A3P40879 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC26A3P40879 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC26A3P40879 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC26A3P40879 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC26A3P40879 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC26A3P40879 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC26A3P40879 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC26A3P40879 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC26A3P40879 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC26A3P40879 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC26A3P40879 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC26A3P40879 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC26A3P40879 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC26A3P40879 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC26A3P40879 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC26A3P40879 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC26A3P40879 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC26A3P40879 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC26A3P40879 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC26A3P40879 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC26A3P40879 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC26A3P40879 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC26A3P40879 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC26A3P40879 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC26A3P40879 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC26A3P40879 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC26A3P40879 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC26A3P40879 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC26A3P40879 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC26A3P40879 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC26A3P40879 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC26A3P40879 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC26A3P40879 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC26A3P40879 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC26A3P40879 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC26A3P40879 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC26A3P40879 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC26A3P40879 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC26A3P40879 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC26A3P40879 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC26A3P40879 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC26A3P40879 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC26A3P40879 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC26A3P40879 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC26A3P40879 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC26A3P40879 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC26A3P40879 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC26A3P40879 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC26A3P40879 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC26A3P40879 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC26A3P40879 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC26A3P40879 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC26A3P40879 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC26A3P40879 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC26A3P40879 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC26A3P40879 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC26A3P40879 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC26A3P40879 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC26A3P40879 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC26A3P40879 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC26A3P40879 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC26A3P40879 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC26A3P40879 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC26A3P40879 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC26A3P40879 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC26A3P40879 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC26A3P40879 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms