Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA7P36544 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA7P36544 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA7P36544 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA7P36544 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA7P36544 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA7P36544 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA7P36544 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA7P36544 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA7P36544 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA7P36544 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA7P36544 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA7P36544 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA7P36544 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA7P36544 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA7P36544 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA7P36544 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA7P36544 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA7P36544 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA7P36544 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA7P36544 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA7P36544 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA7P36544 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA7P36544 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA7P36544 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA7P36544 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA7P36544 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA7P36544 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA7P36544 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA7P36544 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA7P36544 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA7P36544 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA7P36544 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA7P36544 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA7P36544 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA7P36544 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA7P36544 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA7P36544 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA7P36544 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA7P36544 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA7P36544 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA7P36544 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA7P36544 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA7P36544 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA7P36544 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA7P36544 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms