Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASQ1P31415 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASQ1P31415 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASQ1P31415 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASQ1P31415 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASQ1P31415 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASQ1P31415 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASQ1P31415 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASQ1P31415 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASQ1P31415 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASQ1P31415 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASQ1P31415 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASQ1P31415 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASQ1P31415 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASQ1P31415 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASQ1P31415 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASQ1P31415 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASQ1P31415 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASQ1P31415 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASQ1P31415 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASQ1P31415 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASQ1P31415 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASQ1P31415 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASQ1P31415 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASQ1P31415 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASQ1P31415 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASQ1P31415 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASQ1P31415 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASQ1P31415 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASQ1P31415 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASQ1P31415 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASQ1P31415 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASQ1P31415 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASQ1P31415 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASQ1P31415 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASQ1P31415 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASQ1P31415 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASQ1P31415 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASQ1P31415 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASQ1P31415 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASQ1P31415 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASQ1P31415 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASQ1P31415 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASQ1P31415 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CASQ1P31415 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASQ1P31415 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASQ1P31415 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASQ1P31415 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASQ1P31415 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASQ1P31415 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASQ1P31415 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASQ1P31415 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASQ1P31415 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASQ1P31415 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASQ1P31415 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASQ1P31415 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASQ1P31415 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASQ1P31415 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASQ1P31415 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASQ1P31415 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASQ1P31415 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASQ1P31415 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASQ1P31415 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASQ1P31415 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASQ1P31415 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASQ1P31415 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASQ1P31415 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASQ1P31415 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASQ1P31415 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASQ1P31415 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASQ1P31415 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASQ1P31415 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASQ1P31415 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASQ1P31415 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASQ1P31415 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASQ1P31415 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CASQ1P31415 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASQ1P31415 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASQ1P31415 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASQ1P31415 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASQ1P31415 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASQ1P31415 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CASQ1P31415 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASQ1P31415 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
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