Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMOD1P28289 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMOD1P28289 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMOD1P28289 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD1P28289 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD1P28289 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD1P28289 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMOD1P28289 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TMOD1P28289 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMOD1P28289 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMOD1P28289 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD1P28289 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD1P28289 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD1P28289 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD1P28289 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD1P28289 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD1P28289 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD1P28289 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TMOD1P28289 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD1P28289 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD1P28289 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD1P28289 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMOD1P28289 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD1P28289 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD1P28289 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD1P28289 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD1P28289 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD1P28289 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD1P28289 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD1P28289 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD1P28289 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMOD1P28289 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMOD1P28289 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMOD1P28289 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD1P28289 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMOD1P28289 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMOD1P28289 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMOD1P28289 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMOD1P28289 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD1P28289 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms