Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TMOD1P28289 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TMOD1P28289 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TMOD1P28289 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TMOD1P28289 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TMOD1P28289 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TMOD1P28289 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TMOD1P28289 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TMOD1P28289 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TMOD1P28289 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TMOD1P28289 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TMOD1P28289 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TMOD1P28289 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TMOD1P28289 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TMOD1P28289 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TMOD1P28289 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TMOD1P28289 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TMOD1P28289 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TMOD1P28289 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TMOD1P28289 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TMOD1P28289 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TMOD1P28289 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TMOD1P28289 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TMOD1P28289 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TMOD1P28289 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TMOD1P28289 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TMOD1P28289 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TMOD1P28289 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TMOD1P28289 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TMOD1P28289 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TMOD1P28289 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TMOD1P28289 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TMOD1P28289 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TMOD1P28289 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TMOD1P28289 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TMOD1P28289 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TMOD1P28289 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TMOD1P28289 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TMOD1P28289 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.82■■■■□ 3
TMOD1P28289 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TMOD1P28289 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TMOD1P28289 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TMOD1P28289 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TMOD1P28289 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TMOD1P28289 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TMOD1P28289 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TMOD1P28289 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TMOD1P28289 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TMOD1P28289 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TMOD1P28289 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TMOD1P28289 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TMOD1P28289 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TMOD1P28289 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TMOD1P28289 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TMOD1P28289 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TMOD1P28289 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TMOD1P28289 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TMOD1P28289 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TMOD1P28289 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TMOD1P28289 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TMOD1P28289 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TMOD1P28289 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TMOD1P28289 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMOD1P28289 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TMOD1P28289 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TMOD1P28289 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TMOD1P28289 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TMOD1P28289 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TMOD1P28289 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TMOD1P28289 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TMOD1P28289 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TMOD1P28289 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TMOD1P28289 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TMOD1P28289 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TMOD1P28289 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TMOD1P28289 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
TMOD1P28289 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMOD1P28289 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TMOD1P28289 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TMOD1P28289 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TMOD1P28289 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TMOD1P28289 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMOD1P28289 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMOD1P28289 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMOD1P28289 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TMOD1P28289 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TMOD1P28289 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TMOD1P28289 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TMOD1P28289 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TMOD1P28289 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TMOD1P28289 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TMOD1P28289 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TMOD1P28289 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TMOD1P28289 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TMOD1P28289 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TMOD1P28289 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TMOD1P28289 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TMOD1P28289 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TMOD1P28289 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TMOD1P28289 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms