Protein–RNA interactions for Protein: P20962

PTMS, Parathymosin, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMSP20962 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTMSP20962 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTMSP20962 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTMSP20962 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTMSP20962 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTMSP20962 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTMSP20962 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTMSP20962 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTMSP20962 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTMSP20962 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTMSP20962 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTMSP20962 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTMSP20962 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTMSP20962 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTMSP20962 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTMSP20962 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTMSP20962 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTMSP20962 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTMSP20962 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTMSP20962 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTMSP20962 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTMSP20962 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTMSP20962 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTMSP20962 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTMSP20962 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTMSP20962 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTMSP20962 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTMSP20962 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTMSP20962 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTMSP20962 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTMSP20962 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTMSP20962 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTMSP20962 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTMSP20962 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTMSP20962 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTMSP20962 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTMSP20962 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTMSP20962 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTMSP20962 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTMSP20962 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTMSP20962 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTMSP20962 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTMSP20962 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTMSP20962 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTMSP20962 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTMSP20962 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTMSP20962 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTMSP20962 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTMSP20962 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTMSP20962 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTMSP20962 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTMSP20962 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTMSP20962 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTMSP20962 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTMSP20962 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTMSP20962 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTMSP20962 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTMSP20962 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
PTMSP20962 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTMSP20962 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTMSP20962 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTMSP20962 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTMSP20962 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTMSP20962 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTMSP20962 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTMSP20962 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTMSP20962 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTMSP20962 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTMSP20962 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTMSP20962 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PTMSP20962 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTMSP20962 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTMSP20962 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTMSP20962 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTMSP20962 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTMSP20962 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTMSP20962 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTMSP20962 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTMSP20962 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PTMSP20962 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTMSP20962 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTMSP20962 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTMSP20962 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTMSP20962 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTMSP20962 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTMSP20962 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTMSP20962 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTMSP20962 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTMSP20962 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTMSP20962 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTMSP20962 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTMSP20962 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTMSP20962 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTMSP20962 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTMSP20962 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTMSP20962 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTMSP20962 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTMSP20962 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTMSP20962 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTMSP20962 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms