Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GM2AP17900 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GM2AP17900 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GM2AP17900 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GM2AP17900 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GM2AP17900 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GM2AP17900 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GM2AP17900 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GM2AP17900 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GM2AP17900 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GM2AP17900 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GM2AP17900 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GM2AP17900 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GM2AP17900 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GM2AP17900 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GM2AP17900 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GM2AP17900 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GM2AP17900 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GM2AP17900 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
GM2AP17900 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GM2AP17900 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GM2AP17900 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GM2AP17900 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GM2AP17900 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GM2AP17900 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GM2AP17900 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GM2AP17900 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GM2AP17900 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GM2AP17900 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GM2AP17900 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GM2AP17900 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GM2AP17900 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GM2AP17900 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GM2AP17900 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GM2AP17900 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GM2AP17900 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GM2AP17900 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GM2AP17900 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GM2AP17900 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GM2AP17900 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GM2AP17900 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GM2AP17900 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GM2AP17900 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GM2AP17900 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GM2AP17900 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GM2AP17900 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GM2AP17900 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GM2AP17900 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GM2AP17900 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GM2AP17900 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GM2AP17900 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GM2AP17900 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GM2AP17900 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GM2AP17900 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GM2AP17900 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GM2AP17900 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GM2AP17900 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GM2AP17900 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GM2AP17900 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GM2AP17900 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GM2AP17900 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GM2AP17900 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GM2AP17900 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GM2AP17900 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GM2AP17900 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GM2AP17900 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GM2AP17900 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GM2AP17900 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GM2AP17900 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GM2AP17900 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GM2AP17900 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GM2AP17900 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GM2AP17900 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GM2AP17900 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GM2AP17900 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GM2AP17900 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GM2AP17900 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GM2AP17900 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GM2AP17900 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GM2AP17900 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GM2AP17900 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GM2AP17900 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GM2AP17900 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GM2AP17900 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GM2AP17900 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GM2AP17900 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GM2AP17900 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GM2AP17900 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GM2AP17900 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GM2AP17900 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GM2AP17900 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GM2AP17900 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GM2AP17900 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GM2AP17900 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GM2AP17900 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GM2AP17900 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GM2AP17900 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GM2AP17900 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GM2AP17900 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GM2AP17900 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms