Protein–RNA interactions for Protein: P0C7T8

TMEM253, Transmembrane protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM253P0C7T8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM253P0C7T8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM253P0C7T8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM253P0C7T8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM253P0C7T8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM253P0C7T8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM253P0C7T8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM253P0C7T8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM253P0C7T8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM253P0C7T8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM253P0C7T8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM253P0C7T8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM253P0C7T8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM253P0C7T8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM253P0C7T8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM253P0C7T8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM253P0C7T8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM253P0C7T8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM253P0C7T8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM253P0C7T8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM253P0C7T8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM253P0C7T8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM253P0C7T8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM253P0C7T8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM253P0C7T8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM253P0C7T8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM253P0C7T8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM253P0C7T8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM253P0C7T8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM253P0C7T8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM253P0C7T8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM253P0C7T8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM253P0C7T8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM253P0C7T8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM253P0C7T8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM253P0C7T8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM253P0C7T8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM253P0C7T8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM253P0C7T8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM253P0C7T8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM253P0C7T8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM253P0C7T8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM253P0C7T8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM253P0C7T8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM253P0C7T8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM253P0C7T8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM253P0C7T8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM253P0C7T8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM253P0C7T8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM253P0C7T8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM253P0C7T8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM253P0C7T8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM253P0C7T8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM253P0C7T8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM253P0C7T8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM253P0C7T8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM253P0C7T8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM253P0C7T8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM253P0C7T8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM253P0C7T8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM253P0C7T8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM253P0C7T8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM253P0C7T8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM253P0C7T8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM253P0C7T8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM253P0C7T8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM253P0C7T8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM253P0C7T8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM253P0C7T8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM253P0C7T8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM253P0C7T8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM253P0C7T8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM253P0C7T8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM253P0C7T8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM253P0C7T8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM253P0C7T8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms