Protein–RNA interactions for Protein: P08887

IL6R, Interleukin-6 receptor subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL6RP08887 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL6RP08887 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL6RP08887 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL6RP08887 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL6RP08887 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL6RP08887 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL6RP08887 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL6RP08887 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL6RP08887 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL6RP08887 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL6RP08887 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IL6RP08887 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL6RP08887 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL6RP08887 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL6RP08887 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IL6RP08887 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL6RP08887 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL6RP08887 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IL6RP08887 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL6RP08887 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL6RP08887 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL6RP08887 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL6RP08887 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL6RP08887 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL6RP08887 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IL6RP08887 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IL6RP08887 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IL6RP08887 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IL6RP08887 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IL6RP08887 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IL6RP08887 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IL6RP08887 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IL6RP08887 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IL6RP08887 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IL6RP08887 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IL6RP08887 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL6RP08887 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL6RP08887 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL6RP08887 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL6RP08887 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL6RP08887 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IL6RP08887 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IL6RP08887 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IL6RP08887 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IL6RP08887 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IL6RP08887 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
IL6RP08887 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IL6RP08887 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IL6RP08887 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IL6RP08887 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IL6RP08887 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IL6RP08887 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IL6RP08887 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IL6RP08887 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IL6RP08887 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IL6RP08887 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IL6RP08887 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IL6RP08887 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IL6RP08887 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IL6RP08887 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IL6RP08887 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IL6RP08887 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL6RP08887 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL6RP08887 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IL6RP08887 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL6RP08887 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL6RP08887 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL6RP08887 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL6RP08887 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL6RP08887 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL6RP08887 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL6RP08887 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL6RP08887 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL6RP08887 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL6RP08887 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL6RP08887 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL6RP08887 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL6RP08887 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL6RP08887 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL6RP08887 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL6RP08887 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL6RP08887 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL6RP08887 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL6RP08887 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL6RP08887 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IL6RP08887 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL6RP08887 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL6RP08887 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL6RP08887 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL6RP08887 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL6RP08887 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL6RP08887 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL6RP08887 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL6RP08887 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL6RP08887 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL6RP08887 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL6RP08887 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL6RP08887 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IL6RP08887 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IL6RP08887 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.3 ms