Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOA4P06727 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOA4P06727 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOA4P06727 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOA4P06727 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOA4P06727 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOA4P06727 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOA4P06727 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
APOA4P06727 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOA4P06727 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOA4P06727 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOA4P06727 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOA4P06727 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOA4P06727 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOA4P06727 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
APOA4P06727 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
APOA4P06727 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOA4P06727 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOA4P06727 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOA4P06727 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOA4P06727 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOA4P06727 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOA4P06727 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOA4P06727 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOA4P06727 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOA4P06727 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOA4P06727 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOA4P06727 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOA4P06727 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOA4P06727 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOA4P06727 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOA4P06727 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA4P06727 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA4P06727 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA4P06727 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA4P06727 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA4P06727 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA4P06727 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOA4P06727 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOA4P06727 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOA4P06727 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
APOA4P06727 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOA4P06727 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOA4P06727 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOA4P06727 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOA4P06727 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOA4P06727 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOA4P06727 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOA4P06727 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOA4P06727 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOA4P06727 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOA4P06727 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
APOA4P06727 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOA4P06727 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOA4P06727 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOA4P06727 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOA4P06727 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOA4P06727 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
APOA4P06727 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOA4P06727 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOA4P06727 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOA4P06727 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOA4P06727 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOA4P06727 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOA4P06727 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
APOA4P06727 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOA4P06727 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOA4P06727 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOA4P06727 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA4P06727 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA4P06727 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA4P06727 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOA4P06727 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOA4P06727 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
APOA4P06727 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOA4P06727 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOA4P06727 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOA4P06727 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOA4P06727 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
APOA4P06727 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOA4P06727 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOA4P06727 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOA4P06727 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOA4P06727 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOA4P06727 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOA4P06727 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOA4P06727 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOA4P06727 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOA4P06727 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOA4P06727 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOA4P06727 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOA4P06727 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
APOA4P06727 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOA4P06727 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOA4P06727 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOA4P06727 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOA4P06727 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOA4P06727 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOA4P06727 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA4P06727 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms