Protein–RNA interactions for Protein: P03905

MT-ND4, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND4P03905 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND4P03905 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MT-ND4P03905 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MT-ND4P03905 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MT-ND4P03905 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MT-ND4P03905 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MT-ND4P03905 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MT-ND4P03905 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MT-ND4P03905 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND4P03905 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND4P03905 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND4P03905 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MT-ND4P03905 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ND4P03905 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ND4P03905 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ND4P03905 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ND4P03905 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-ND4P03905 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND4P03905 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms