Protein–RNA interactions for Protein: P03891

MT-ND2, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND2P03891 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-ND2P03891 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-ND2P03891 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-ND2P03891 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MT-ND2P03891 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MT-ND2P03891 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MT-ND2P03891 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MT-ND2P03891 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MT-ND2P03891 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MT-ND2P03891 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MT-ND2P03891 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MT-ND2P03891 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MT-ND2P03891 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MT-ND2P03891 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MT-ND2P03891 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MT-ND2P03891 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MT-ND2P03891 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MT-ND2P03891 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-ND2P03891 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND2P03891 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MT-ND2P03891 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MT-ND2P03891 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MT-ND2P03891 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MT-ND2P03891 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MT-ND2P03891 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MT-ND2P03891 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND2P03891 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND2P03891 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND2P03891 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND2P03891 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MT-ND2P03891 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MT-ND2P03891 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MT-ND2P03891 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MT-ND2P03891 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MT-ND2P03891 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MT-ND2P03891 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms