Protein–RNA interactions for Protein: P01871

IGHM, Immunoglobulin heavy constant mu, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMP01871 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGHMP01871 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGHMP01871 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGHMP01871 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGHMP01871 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGHMP01871 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGHMP01871 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGHMP01871 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGHMP01871 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGHMP01871 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGHMP01871 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGHMP01871 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGHMP01871 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGHMP01871 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGHMP01871 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGHMP01871 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGHMP01871 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGHMP01871 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGHMP01871 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGHMP01871 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGHMP01871 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGHMP01871 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGHMP01871 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGHMP01871 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGHMP01871 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGHMP01871 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IGHMP01871 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHMP01871 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHMP01871 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHMP01871 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHMP01871 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHMP01871 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHMP01871 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHMP01871 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGHMP01871 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGHMP01871 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGHMP01871 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGHMP01871 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGHMP01871 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHMP01871 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHMP01871 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHMP01871 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHMP01871 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHMP01871 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHMP01871 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
IGHMP01871 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGHMP01871 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGHMP01871 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGHMP01871 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGHMP01871 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGHMP01871 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHMP01871 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHMP01871 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHMP01871 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGHMP01871 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGHMP01871 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGHMP01871 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHMP01871 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHMP01871 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHMP01871 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHMP01871 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHMP01871 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHMP01871 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHMP01871 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHMP01871 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHMP01871 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHMP01871 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHMP01871 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHMP01871 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHMP01871 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHMP01871 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHMP01871 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGHMP01871 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGHMP01871 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGHMP01871 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGHMP01871 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHMP01871 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHMP01871 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHMP01871 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHMP01871 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHMP01871 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHMP01871 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHMP01871 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHMP01871 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHMP01871 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHMP01871 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHMP01871 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHMP01871 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHMP01871 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHMP01871 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHMP01871 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGHMP01871 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGHMP01871 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHMP01871 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHMP01871 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHMP01871 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHMP01871 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHMP01871 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHMP01871 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHMP01871 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms