Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALCAP01258 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALCAP01258 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALCAP01258 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALCAP01258 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALCAP01258 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALCAP01258 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALCAP01258 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALCAP01258 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALCAP01258 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALCAP01258 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALCAP01258 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALCAP01258 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALCAP01258 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALCAP01258 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALCAP01258 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALCAP01258 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALCAP01258 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALCAP01258 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALCAP01258 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALCAP01258 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CALCAP01258 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALCAP01258 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALCAP01258 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALCAP01258 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALCAP01258 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALCAP01258 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALCAP01258 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALCAP01258 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALCAP01258 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALCAP01258 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALCAP01258 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALCAP01258 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALCAP01258 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALCAP01258 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALCAP01258 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALCAP01258 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALCAP01258 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CALCAP01258 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALCAP01258 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALCAP01258 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CALCAP01258 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALCAP01258 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALCAP01258 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALCAP01258 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALCAP01258 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALCAP01258 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALCAP01258 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALCAP01258 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALCAP01258 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALCAP01258 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALCAP01258 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALCAP01258 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALCAP01258 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALCAP01258 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALCAP01258 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALCAP01258 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALCAP01258 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALCAP01258 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALCAP01258 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALCAP01258 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CALCAP01258 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CALCAP01258 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALCAP01258 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CALCAP01258 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALCAP01258 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALCAP01258 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALCAP01258 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALCAP01258 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CALCAP01258 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CALCAP01258 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALCAP01258 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALCAP01258 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALCAP01258 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALCAP01258 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALCAP01258 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALCAP01258 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALCAP01258 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALCAP01258 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALCAP01258 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALCAP01258 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALCAP01258 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALCAP01258 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALCAP01258 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CALCAP01258 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CALCAP01258 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALCAP01258 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALCAP01258 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALCAP01258 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALCAP01258 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALCAP01258 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALCAP01258 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALCAP01258 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALCAP01258 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALCAP01258 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALCAP01258 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALCAP01258 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALCAP01258 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALCAP01258 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CALCAP01258 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms