Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CALCAP01258 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CALCAP01258 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CALCAP01258 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CALCAP01258 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CALCAP01258 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CALCAP01258 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CALCAP01258 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CALCAP01258 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CALCAP01258 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CALCAP01258 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CALCAP01258 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CALCAP01258 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CALCAP01258 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CALCAP01258 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CALCAP01258 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CALCAP01258 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CALCAP01258 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CALCAP01258 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CALCAP01258 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CALCAP01258 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CALCAP01258 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CALCAP01258 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CALCAP01258 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CALCAP01258 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CALCAP01258 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CALCAP01258 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CALCAP01258 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CALCAP01258 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CALCAP01258 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CALCAP01258 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CALCAP01258 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CALCAP01258 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CALCAP01258 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CALCAP01258 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CALCAP01258 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CALCAP01258 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CALCAP01258 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CALCAP01258 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CALCAP01258 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CALCAP01258 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CALCAP01258 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CALCAP01258 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CALCAP01258 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CALCAP01258 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CALCAP01258 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CALCAP01258 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CALCAP01258 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CALCAP01258 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CALCAP01258 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CALCAP01258 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CALCAP01258 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CALCAP01258 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CALCAP01258 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CALCAP01258 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CALCAP01258 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CALCAP01258 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CALCAP01258 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
CALCAP01258 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CALCAP01258 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CALCAP01258 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CALCAP01258 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CALCAP01258 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CALCAP01258 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CALCAP01258 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CALCAP01258 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CALCAP01258 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CALCAP01258 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CALCAP01258 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CALCAP01258 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CALCAP01258 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CALCAP01258 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CALCAP01258 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CALCAP01258 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CALCAP01258 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CALCAP01258 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CALCAP01258 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CALCAP01258 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CALCAP01258 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CALCAP01258 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CALCAP01258 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CALCAP01258 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CALCAP01258 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CALCAP01258 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CALCAP01258 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CALCAP01258 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CALCAP01258 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CALCAP01258 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CALCAP01258 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CALCAP01258 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CALCAP01258 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CALCAP01258 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CALCAP01258 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CALCAP01258 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CALCAP01258 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CALCAP01258 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CALCAP01258 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CALCAP01258 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CALCAP01258 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CALCAP01258 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms