Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF6BO95407 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF6BO95407 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF6BO95407 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF6BO95407 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFRSF6BO95407 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFRSF6BO95407 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF6BO95407 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF6BO95407 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFRSF6BO95407 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFRSF6BO95407 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms