Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC31AO94979 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC31AO94979 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC31AO94979 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC31AO94979 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC31AO94979 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31AO94979 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31AO94979 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC31AO94979 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC31AO94979 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC31AO94979 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC31AO94979 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC31AO94979 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC31AO94979 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC31AO94979 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC31AO94979 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SEC31AO94979 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SEC31AO94979 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEC31AO94979 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC31AO94979 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC31AO94979 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC31AO94979 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC31AO94979 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC31AO94979 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC31AO94979 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEC31AO94979 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC31AO94979 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SEC31AO94979 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31AO94979 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31AO94979 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31AO94979 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC31AO94979 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC31AO94979 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC31AO94979 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC31AO94979 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC31AO94979 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC31AO94979 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC31AO94979 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC31AO94979 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC31AO94979 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC31AO94979 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SEC31AO94979 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC31AO94979 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEC31AO94979 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEC31AO94979 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEC31AO94979 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC31AO94979 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC31AO94979 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC31AO94979 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC31AO94979 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC31AO94979 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC31AO94979 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC31AO94979 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms