Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR47O94967 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR47O94967 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR47O94967 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR47O94967 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR47O94967 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR47O94967 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR47O94967 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR47O94967 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR47O94967 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR47O94967 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR47O94967 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR47O94967 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR47O94967 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR47O94967 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR47O94967 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR47O94967 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR47O94967 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR47O94967 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR47O94967 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR47O94967 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR47O94967 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR47O94967 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR47O94967 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR47O94967 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR47O94967 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR47O94967 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR47O94967 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR47O94967 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR47O94967 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR47O94967 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR47O94967 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR47O94967 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR47O94967 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR47O94967 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR47O94967 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR47O94967 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR47O94967 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR47O94967 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR47O94967 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR47O94967 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR47O94967 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR47O94967 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR47O94967 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR47O94967 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR47O94967 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR47O94967 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR47O94967 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR47O94967 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR47O94967 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR47O94967 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR47O94967 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR47O94967 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR47O94967 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR47O94967 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR47O94967 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR47O94967 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR47O94967 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR47O94967 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR47O94967 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR47O94967 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR47O94967 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR47O94967 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR47O94967 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR47O94967 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR47O94967 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR47O94967 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR47O94967 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR47O94967 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR47O94967 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR47O94967 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR47O94967 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR47O94967 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR47O94967 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR47O94967 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR47O94967 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR47O94967 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
WDR47O94967 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR47O94967 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR47O94967 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR47O94967 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR47O94967 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR47O94967 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR47O94967 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR47O94967 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR47O94967 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR47O94967 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR47O94967 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR47O94967 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR47O94967 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR47O94967 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR47O94967 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR47O94967 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR47O94967 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR47O94967 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR47O94967 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR47O94967 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR47O94967 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR47O94967 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR47O94967 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms