Protein–RNA interactions for Protein: O60583

CCNT2, Cyclin-T2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT2O60583 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNT2O60583 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCNT2O60583 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNT2O60583 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNT2O60583 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNT2O60583 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNT2O60583 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNT2O60583 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNT2O60583 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNT2O60583 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNT2O60583 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNT2O60583 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNT2O60583 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNT2O60583 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNT2O60583 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCNT2O60583 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCNT2O60583 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNT2O60583 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNT2O60583 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNT2O60583 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNT2O60583 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNT2O60583 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNT2O60583 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNT2O60583 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNT2O60583 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNT2O60583 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNT2O60583 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNT2O60583 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNT2O60583 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNT2O60583 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNT2O60583 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNT2O60583 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNT2O60583 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNT2O60583 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNT2O60583 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNT2O60583 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNT2O60583 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNT2O60583 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNT2O60583 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNT2O60583 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNT2O60583 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNT2O60583 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNT2O60583 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNT2O60583 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCNT2O60583 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms