Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME2P1O60361 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME2P1O60361 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME2P1O60361 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME2P1O60361 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME2P1O60361 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME2P1O60361 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME2P1O60361 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME2P1O60361 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME2P1O60361 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME2P1O60361 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME2P1O60361 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME2P1O60361 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME2P1O60361 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME2P1O60361 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME2P1O60361 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME2P1O60361 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME2P1O60361 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME2P1O60361 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME2P1O60361 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NME2P1O60361 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME2P1O60361 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME2P1O60361 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME2P1O60361 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME2P1O60361 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME2P1O60361 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME2P1O60361 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME2P1O60361 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME2P1O60361 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NME2P1O60361 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME2P1O60361 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME2P1O60361 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME2P1O60361 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME2P1O60361 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NME2P1O60361 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME2P1O60361 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms