Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3QRK9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3QRK9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3QRK9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
J3QRK9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3QRK9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
J3QRK9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
J3QRK9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
J3QRK9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
J3QRK9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
J3QRK9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
J3QRK9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
J3QRK9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
J3QRK9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
J3QRK9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
J3QRK9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
J3QRK9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
J3QRK9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
J3QRK9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
J3QRK9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
J3QRK9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
J3QRK9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
J3QRK9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
J3QRK9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
J3QRK9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
J3QRK9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
J3QRK9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
J3QRK9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
J3QRK9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
J3QRK9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
J3QRK9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
J3QRK9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
J3QRK9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
J3QRK9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3QRK9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3QRK9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3QRK9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
J3QRK9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3QRK9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3QRK9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3QRK9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
J3QRK9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
J3QRK9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
J3QRK9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
J3QRK9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
J3QRK9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
J3QRK9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
J3QRK9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
J3QRK9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
J3QRK9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
J3QRK9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
J3QRK9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
J3QRK9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
J3QRK9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
J3QRK9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QRK9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QRK9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QRK9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QRK9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QRK9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
J3QRK9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
J3QRK9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
J3QRK9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
J3QRK9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
J3QRK9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
J3QRK9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
J3QRK9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3QRK9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3QRK9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3QRK9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3QRK9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3QRK9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
J3QRK9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
J3QRK9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
J3QRK9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
J3QRK9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
J3QRK9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
J3QRK9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3QRK9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3QRK9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3QRK9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
J3QRK9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
J3QRK9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
J3QRK9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
J3QRK9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
J3QRK9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
J3QRK9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
J3QRK9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
J3QRK9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
J3QRK9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
J3QRK9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
J3QRK9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
J3QRK9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
J3QRK9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
J3QRK9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
J3QRK9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
J3QRK9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
J3QRK9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
J3QRK9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
J3QRK9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms