Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
B4DEV8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
B4DEV8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
B4DEV8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
B4DEV8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DEV8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
B4DEV8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
B4DEV8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
B4DEV8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
B4DEV8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
B4DEV8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
B4DEV8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
B4DEV8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
B4DEV8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
B4DEV8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
B4DEV8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
B4DEV8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
B4DEV8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
B4DEV8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
B4DEV8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
B4DEV8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
B4DEV8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
B4DEV8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
B4DEV8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
B4DEV8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
B4DEV8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
B4DEV8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
B4DEV8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
B4DEV8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
B4DEV8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
B4DEV8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
B4DEV8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
B4DEV8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
B4DEV8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
B4DEV8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
B4DEV8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
B4DEV8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
B4DEV8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
B4DEV8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DEV8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DEV8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DEV8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DEV8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
B4DEV8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
B4DEV8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
B4DEV8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
B4DEV8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DEV8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DEV8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DEV8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DEV8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
B4DEV8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
B4DEV8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
B4DEV8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
B4DEV8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
B4DEV8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
B4DEV8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
B4DEV8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
B4DEV8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
B4DEV8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
B4DEV8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
B4DEV8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
B4DEV8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
B4DEV8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
B4DEV8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
B4DEV8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
B4DEV8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
B4DEV8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
B4DEV8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
B4DEV8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
B4DEV8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
B4DEV8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
B4DEV8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
B4DEV8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
B4DEV8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
B4DEV8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
B4DEV8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
B4DEV8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
B4DEV8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
B4DEV8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
B4DEV8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DEV8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DEV8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DEV8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DEV8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DEV8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DEV8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DEV8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DEV8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DEV8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DEV8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DEV8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
B4DEV8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
B4DEV8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
B4DEV8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B4DEV8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
B4DEV8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
B4DEV8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
B4DEV8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
B4DEV8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms