Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF25A6NGN4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF25A6NGN4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF25A6NGN4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF25A6NGN4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF25A6NGN4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF25A6NGN4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF25A6NGN4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF25A6NGN4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF25A6NGN4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF25A6NGN4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF25A6NGN4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF25A6NGN4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF25A6NGN4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF25A6NGN4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF25A6NGN4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF25A6NGN4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF25A6NGN4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF25A6NGN4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF25A6NGN4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF25A6NGN4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF25A6NGN4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF25A6NGN4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF25A6NGN4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF25A6NGN4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF25A6NGN4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF25A6NGN4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF25A6NGN4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAMEF25A6NGN4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF25A6NGN4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF25A6NGN4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF25A6NGN4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF25A6NGN4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF25A6NGN4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF25A6NGN4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF25A6NGN4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF25A6NGN4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF25A6NGN4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF25A6NGN4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF25A6NGN4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF25A6NGN4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF25A6NGN4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF25A6NGN4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF25A6NGN4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms