Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPK0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPK0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PPK0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PPK0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PPK0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PPK0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PPK0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PPK0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PPK0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PPK0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PPK0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A1W2PPK0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PPK0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A1W2PPK0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A1W2PPK0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1W2PPK0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1W2PPK0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1W2PPK0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1W2PPK0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1W2PPK0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1W2PPK0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PPK0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PPK0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PPK0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1W2PPK0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1W2PPK0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1W2PPK0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PPK0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PPK0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PPK0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PPK0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PPK0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PPK0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PPK0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PPK0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PPK0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PPK0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PPK0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PPK0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PPK0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1W2PPK0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1W2PPK0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1W2PPK0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
A0A1W2PPK0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
A0A1W2PPK0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1W2PPK0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1W2PPK0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1W2PPK0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1W2PPK0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1W2PPK0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1W2PPK0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1W2PPK0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1W2PPK0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1W2PPK0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1W2PPK0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1W2PPK0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1W2PPK0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PPK0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PPK0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PPK0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PPK0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PPK0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PPK0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPK0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPK0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPK0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPK0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPK0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPK0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPK0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPK0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPK0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPK0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPK0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPK0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPK0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPK0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PPK0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PPK0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPK0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPK0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPK0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms