Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMF1-BGLAPU3KQ54 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMF1-BGLAPU3KQ54 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMF1-BGLAPU3KQ54 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMF1-BGLAPU3KQ54 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PMF1-BGLAPU3KQ54 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMF1-BGLAPU3KQ54 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMF1-BGLAPU3KQ54 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMF1-BGLAPU3KQ54 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PMF1-BGLAPU3KQ54 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PMF1-BGLAPU3KQ54 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PMF1-BGLAPU3KQ54 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMF1-BGLAPU3KQ54 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMF1-BGLAPU3KQ54 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMF1-BGLAPU3KQ54 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMF1-BGLAPU3KQ54 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMF1-BGLAPU3KQ54 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMF1-BGLAPU3KQ54 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMF1-BGLAPU3KQ54 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMF1-BGLAPU3KQ54 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMF1-BGLAPU3KQ54 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMF1-BGLAPU3KQ54 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMF1-BGLAPU3KQ54 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMF1-BGLAPU3KQ54 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMF1-BGLAPU3KQ54 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMF1-BGLAPU3KQ54 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMF1-BGLAPU3KQ54 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMF1-BGLAPU3KQ54 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMF1-BGLAPU3KQ54 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMF1-BGLAPU3KQ54 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMF1-BGLAPU3KQ54 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms