Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S8

NOX1, NADPH oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOX1Q9Y5S8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOX1Q9Y5S8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOX1Q9Y5S8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOX1Q9Y5S8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOX1Q9Y5S8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOX1Q9Y5S8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOX1Q9Y5S8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOX1Q9Y5S8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOX1Q9Y5S8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOX1Q9Y5S8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOX1Q9Y5S8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOX1Q9Y5S8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOX1Q9Y5S8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOX1Q9Y5S8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NOX1Q9Y5S8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOX1Q9Y5S8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOX1Q9Y5S8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOX1Q9Y5S8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOX1Q9Y5S8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOX1Q9Y5S8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOX1Q9Y5S8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOX1Q9Y5S8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOX1Q9Y5S8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOX1Q9Y5S8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOX1Q9Y5S8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOX1Q9Y5S8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOX1Q9Y5S8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOX1Q9Y5S8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOX1Q9Y5S8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOX1Q9Y5S8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOX1Q9Y5S8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOX1Q9Y5S8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOX1Q9Y5S8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOX1Q9Y5S8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOX1Q9Y5S8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOX1Q9Y5S8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOX1Q9Y5S8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOX1Q9Y5S8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOX1Q9Y5S8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOX1Q9Y5S8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOX1Q9Y5S8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOX1Q9Y5S8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOX1Q9Y5S8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOX1Q9Y5S8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOX1Q9Y5S8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOX1Q9Y5S8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOX1Q9Y5S8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOX1Q9Y5S8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOX1Q9Y5S8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOX1Q9Y5S8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOX1Q9Y5S8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOX1Q9Y5S8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOX1Q9Y5S8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOX1Q9Y5S8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NOX1Q9Y5S8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOX1Q9Y5S8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOX1Q9Y5S8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOX1Q9Y5S8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOX1Q9Y5S8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOX1Q9Y5S8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOX1Q9Y5S8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOX1Q9Y5S8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOX1Q9Y5S8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOX1Q9Y5S8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NOX1Q9Y5S8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOX1Q9Y5S8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOX1Q9Y5S8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOX1Q9Y5S8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOX1Q9Y5S8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOX1Q9Y5S8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOX1Q9Y5S8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOX1Q9Y5S8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOX1Q9Y5S8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOX1Q9Y5S8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOX1Q9Y5S8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NOX1Q9Y5S8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOX1Q9Y5S8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOX1Q9Y5S8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOX1Q9Y5S8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOX1Q9Y5S8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOX1Q9Y5S8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOX1Q9Y5S8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms