Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y520

PRRC2C, Protein PRRC2C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2CQ9Y520 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRRC2CQ9Y520 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRRC2CQ9Y520 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRRC2CQ9Y520 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRRC2CQ9Y520 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRRC2CQ9Y520 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRRC2CQ9Y520 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRRC2CQ9Y520 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRRC2CQ9Y520 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRC2CQ9Y520 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRC2CQ9Y520 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRC2CQ9Y520 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRRC2CQ9Y520 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRRC2CQ9Y520 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRC2CQ9Y520 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRC2CQ9Y520 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRC2CQ9Y520 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRC2CQ9Y520 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRC2CQ9Y520 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRC2CQ9Y520 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRC2CQ9Y520 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRC2CQ9Y520 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRC2CQ9Y520 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRRC2CQ9Y520 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRC2CQ9Y520 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRRC2CQ9Y520 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRRC2CQ9Y520 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRRC2CQ9Y520 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRRC2CQ9Y520 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRRC2CQ9Y520 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRC2CQ9Y520 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRC2CQ9Y520 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRC2CQ9Y520 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRC2CQ9Y520 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRRC2CQ9Y520 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRRC2CQ9Y520 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRRC2CQ9Y520 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRRC2CQ9Y520 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRRC2CQ9Y520 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRRC2CQ9Y520 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRRC2CQ9Y520 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRRC2CQ9Y520 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRRC2CQ9Y520 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRRC2CQ9Y520 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRRC2CQ9Y520 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRRC2CQ9Y520 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRRC2CQ9Y520 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRC2CQ9Y520 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRC2CQ9Y520 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRC2CQ9Y520 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRC2CQ9Y520 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRC2CQ9Y520 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRRC2CQ9Y520 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRRC2CQ9Y520 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRRC2CQ9Y520 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRRC2CQ9Y520 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRRC2CQ9Y520 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRRC2CQ9Y520 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRRC2CQ9Y520 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRRC2CQ9Y520 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRRC2CQ9Y520 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRRC2CQ9Y520 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRRC2CQ9Y520 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRRC2CQ9Y520 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRRC2CQ9Y520 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRRC2CQ9Y520 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRRC2CQ9Y520 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRRC2CQ9Y520 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRRC2CQ9Y520 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRRC2CQ9Y520 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRRC2CQ9Y520 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRRC2CQ9Y520 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRRC2CQ9Y520 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRRC2CQ9Y520 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRRC2CQ9Y520 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRRC2CQ9Y520 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRRC2CQ9Y520 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRRC2CQ9Y520 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRC2CQ9Y520 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRC2CQ9Y520 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRC2CQ9Y520 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRRC2CQ9Y520 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRRC2CQ9Y520 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRRC2CQ9Y520 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRRC2CQ9Y520 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRRC2CQ9Y520 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRRC2CQ9Y520 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRRC2CQ9Y520 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRRC2CQ9Y520 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRRC2CQ9Y520 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRRC2CQ9Y520 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRRC2CQ9Y520 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRRC2CQ9Y520 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRRC2CQ9Y520 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRRC2CQ9Y520 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRRC2CQ9Y520 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRRC2CQ9Y520 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRRC2CQ9Y520 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRRC2CQ9Y520 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRRC2CQ9Y520 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms