Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLF12Q9Y4X4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
KLF12Q9Y4X4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLF12Q9Y4X4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLF12Q9Y4X4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLF12Q9Y4X4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLF12Q9Y4X4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
KLF12Q9Y4X4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KLF12Q9Y4X4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLF12Q9Y4X4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLF12Q9Y4X4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLF12Q9Y4X4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF12Q9Y4X4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF12Q9Y4X4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF12Q9Y4X4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF12Q9Y4X4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF12Q9Y4X4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF12Q9Y4X4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF12Q9Y4X4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF12Q9Y4X4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF12Q9Y4X4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF12Q9Y4X4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF12Q9Y4X4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF12Q9Y4X4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF12Q9Y4X4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF12Q9Y4X4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF12Q9Y4X4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF12Q9Y4X4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF12Q9Y4X4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF12Q9Y4X4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF12Q9Y4X4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF12Q9Y4X4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF12Q9Y4X4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF12Q9Y4X4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF12Q9Y4X4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF12Q9Y4X4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF12Q9Y4X4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF12Q9Y4X4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF12Q9Y4X4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF12Q9Y4X4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF12Q9Y4X4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF12Q9Y4X4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF12Q9Y4X4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF12Q9Y4X4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF12Q9Y4X4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF12Q9Y4X4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF12Q9Y4X4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF12Q9Y4X4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF12Q9Y4X4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF12Q9Y4X4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF12Q9Y4X4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF12Q9Y4X4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF12Q9Y4X4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF12Q9Y4X4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF12Q9Y4X4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF12Q9Y4X4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF12Q9Y4X4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF12Q9Y4X4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF12Q9Y4X4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF12Q9Y4X4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF12Q9Y4X4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF12Q9Y4X4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF12Q9Y4X4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF12Q9Y4X4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms