Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y467

SALL2, Sal-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL2Q9Y467 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SALL2Q9Y467 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SALL2Q9Y467 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SALL2Q9Y467 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SALL2Q9Y467 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SALL2Q9Y467 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SALL2Q9Y467 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SALL2Q9Y467 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SALL2Q9Y467 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SALL2Q9Y467 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SALL2Q9Y467 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SALL2Q9Y467 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
SALL2Q9Y467 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SALL2Q9Y467 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SALL2Q9Y467 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SALL2Q9Y467 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SALL2Q9Y467 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
SALL2Q9Y467 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SALL2Q9Y467 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SALL2Q9Y467 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SALL2Q9Y467 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
SALL2Q9Y467 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SALL2Q9Y467 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SALL2Q9Y467 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SALL2Q9Y467 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SALL2Q9Y467 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SALL2Q9Y467 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SALL2Q9Y467 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SALL2Q9Y467 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
SALL2Q9Y467 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SALL2Q9Y467 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SALL2Q9Y467 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SALL2Q9Y467 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SALL2Q9Y467 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SALL2Q9Y467 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SALL2Q9Y467 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SALL2Q9Y467 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SALL2Q9Y467 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SALL2Q9Y467 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SALL2Q9Y467 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SALL2Q9Y467 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SALL2Q9Y467 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
SALL2Q9Y467 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SALL2Q9Y467 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SALL2Q9Y467 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SALL2Q9Y467 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SALL2Q9Y467 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SALL2Q9Y467 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SALL2Q9Y467 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SALL2Q9Y467 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SALL2Q9Y467 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SALL2Q9Y467 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SALL2Q9Y467 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SALL2Q9Y467 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SALL2Q9Y467 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
SALL2Q9Y467 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SALL2Q9Y467 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SALL2Q9Y467 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SALL2Q9Y467 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SALL2Q9Y467 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SALL2Q9Y467 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SALL2Q9Y467 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SALL2Q9Y467 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SALL2Q9Y467 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SALL2Q9Y467 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SALL2Q9Y467 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SALL2Q9Y467 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SALL2Q9Y467 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SALL2Q9Y467 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SALL2Q9Y467 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SALL2Q9Y467 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SALL2Q9Y467 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SALL2Q9Y467 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SALL2Q9Y467 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SALL2Q9Y467 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SALL2Q9Y467 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SALL2Q9Y467 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SALL2Q9Y467 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
SALL2Q9Y467 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
SALL2Q9Y467 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SALL2Q9Y467 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SALL2Q9Y467 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SALL2Q9Y467 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SALL2Q9Y467 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SALL2Q9Y467 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SALL2Q9Y467 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SALL2Q9Y467 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SALL2Q9Y467 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SALL2Q9Y467 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SALL2Q9Y467 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SALL2Q9Y467 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SALL2Q9Y467 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SALL2Q9Y467 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SALL2Q9Y467 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
SALL2Q9Y467 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SALL2Q9Y467 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SALL2Q9Y467 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SALL2Q9Y467 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SALL2Q9Y467 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SALL2Q9Y467 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms