Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC64.92■■■■■ 7.98
NISCHQ9Y2I1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC64.92■■■■■ 7.98
NISCHQ9Y2I1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.91■■■■■ 7.98
NISCHQ9Y2I1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC64.88■■■■■ 7.98
NISCHQ9Y2I1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC64.88■■■■■ 7.98
NISCHQ9Y2I1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC64.87■■■■■ 7.97
NISCHQ9Y2I1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC64.85■■■■■ 7.97
NISCHQ9Y2I1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC64.82■■■■■ 7.97
NISCHQ9Y2I1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC64.8■■■■■ 7.96
NISCHQ9Y2I1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC64.8■■■■■ 7.96
NISCHQ9Y2I1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC64.78■■■■■ 7.96
NISCHQ9Y2I1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC64.76■■■■■ 7.96
NISCHQ9Y2I1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC64.76■■■■■ 7.96
NISCHQ9Y2I1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC64.74■■■■■ 7.96
NISCHQ9Y2I1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC64.74■■■■■ 7.95
NISCHQ9Y2I1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC64.74■■■■■ 7.95
NISCHQ9Y2I1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC64.72■■■■■ 7.95
NISCHQ9Y2I1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC64.72■■■■■ 7.95
NISCHQ9Y2I1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC64.71■■■■■ 7.95
NISCHQ9Y2I1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC64.71■■■■■ 7.95
NISCHQ9Y2I1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC64.69■■■■■ 7.95
NISCHQ9Y2I1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC64.66■■■■■ 7.94
NISCHQ9Y2I1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.63■■■■■ 7.94
NISCHQ9Y2I1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.59■■■■■ 7.93
NISCHQ9Y2I1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC64.59■■■■■ 7.93
NISCHQ9Y2I1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC64.58■■■■■ 7.93
NISCHQ9Y2I1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.56■■■■■ 7.93
NISCHQ9Y2I1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.54■■■■■ 7.92
NISCHQ9Y2I1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC64.54■■■■■ 7.92
NISCHQ9Y2I1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.54■■■■■ 7.92
NISCHQ9Y2I1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC64.54■■■■■ 7.92
NISCHQ9Y2I1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC64.51■■■■■ 7.92
NISCHQ9Y2I1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC64.49■■■■■ 7.91
NISCHQ9Y2I1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.49■■■■■ 7.91
NISCHQ9Y2I1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC64.47■■■■■ 7.91
NISCHQ9Y2I1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC64.44■■■■■ 7.91
NISCHQ9Y2I1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC64.44■■■■■ 7.91
NISCHQ9Y2I1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.42■■■■■ 7.9
NISCHQ9Y2I1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC64.42■■■■■ 7.9
NISCHQ9Y2I1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC64.4■■■■■ 7.9
NISCHQ9Y2I1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC64.39■■■■■ 7.9
NISCHQ9Y2I1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.38■■■■■ 7.9
NISCHQ9Y2I1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.33■■■■■ 7.89
NISCHQ9Y2I1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC64.31■■■■■ 7.89
NISCHQ9Y2I1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC64.31■■■■■ 7.89
NISCHQ9Y2I1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.3■■■■■ 7.88
NISCHQ9Y2I1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC64.3■■■■■ 7.88
NISCHQ9Y2I1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC64.28■■■■■ 7.88
NISCHQ9Y2I1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC64.28■■■■■ 7.88
NISCHQ9Y2I1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.26■■■■■ 7.88
NISCHQ9Y2I1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.25■■■■■ 7.88
NISCHQ9Y2I1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC64.24■■■■■ 7.87
NISCHQ9Y2I1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.23■■■■■ 7.87
NISCHQ9Y2I1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC64.21■■■■■ 7.87
NISCHQ9Y2I1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC64.18■■■■■ 7.87
NISCHQ9Y2I1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC64.18■■■■■ 7.86
NISCHQ9Y2I1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC64.17■■■■■ 7.86
NISCHQ9Y2I1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.16■■■■■ 7.86
NISCHQ9Y2I1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.14■■■■■ 7.86
NISCHQ9Y2I1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC64.13■■■■■ 7.86
NISCHQ9Y2I1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC64.13■■■■■ 7.86
NISCHQ9Y2I1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC64.13■■■■■ 7.86
NISCHQ9Y2I1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC64.09■■■■■ 7.85
NISCHQ9Y2I1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC64.08■■■■■ 7.85
NISCHQ9Y2I1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.07■■■■■ 7.85
NISCHQ9Y2I1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC64.07■■■■■ 7.85
NISCHQ9Y2I1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.07■■■■■ 7.85
NISCHQ9Y2I1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC64.05■■■■■ 7.84
NISCHQ9Y2I1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC64.05■■■■■ 7.84
NISCHQ9Y2I1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.03■■■■■ 7.84
NISCHQ9Y2I1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC63.98■■■■■ 7.83
NISCHQ9Y2I1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC63.98■■■■■ 7.83
NISCHQ9Y2I1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.97■■■■■ 7.83
NISCHQ9Y2I1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC63.96■■■■■ 7.83
NISCHQ9Y2I1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.95■■■■■ 7.83
NISCHQ9Y2I1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC63.93■■■■■ 7.82
NISCHQ9Y2I1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC63.93■■■■■ 7.82
NISCHQ9Y2I1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC63.92■■■■■ 7.82
NISCHQ9Y2I1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC63.91■■■■■ 7.82
NISCHQ9Y2I1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.88■■■■■ 7.82
NISCHQ9Y2I1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.87■■■■■ 7.82
NISCHQ9Y2I1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC63.84■■■■■ 7.81
NISCHQ9Y2I1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC63.84■■■■■ 7.81
NISCHQ9Y2I1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC63.83■■■■■ 7.81
NISCHQ9Y2I1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC63.81■■■■■ 7.81
NISCHQ9Y2I1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC63.81■■■■■ 7.81
NISCHQ9Y2I1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.8■■■■■ 7.8
NISCHQ9Y2I1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC63.79■■■■■ 7.8
NISCHQ9Y2I1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC63.78■■■■■ 7.8
NISCHQ9Y2I1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC63.77■■■■■ 7.8
NISCHQ9Y2I1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC63.75■■■■■ 7.8
NISCHQ9Y2I1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.74■■■■■ 7.79
NISCHQ9Y2I1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC63.72■■■■■ 7.79
NISCHQ9Y2I1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC63.72■■■■■ 7.79
NISCHQ9Y2I1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC63.72■■■■■ 7.79
NISCHQ9Y2I1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC63.71■■■■■ 7.79
NISCHQ9Y2I1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.7■■■■■ 7.79
NISCHQ9Y2I1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC63.69■■■■■ 7.79
NISCHQ9Y2I1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.67■■■■■ 7.78
NISCHQ9Y2I1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC63.67■■■■■ 7.78
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