Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TNNQ9UQP3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TNNQ9UQP3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TNNQ9UQP3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TNNQ9UQP3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TNNQ9UQP3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TNNQ9UQP3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TNNQ9UQP3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TNNQ9UQP3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TNNQ9UQP3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TNNQ9UQP3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TNNQ9UQP3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TNNQ9UQP3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
TNNQ9UQP3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNNQ9UQP3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNNQ9UQP3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TNNQ9UQP3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
TNNQ9UQP3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TNNQ9UQP3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNNQ9UQP3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNNQ9UQP3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNNQ9UQP3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNNQ9UQP3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNNQ9UQP3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TNNQ9UQP3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TNNQ9UQP3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TNNQ9UQP3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNNQ9UQP3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNNQ9UQP3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
TNNQ9UQP3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TNNQ9UQP3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TNNQ9UQP3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TNNQ9UQP3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNNQ9UQP3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNNQ9UQP3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNNQ9UQP3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNNQ9UQP3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
TNNQ9UQP3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNNQ9UQP3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNNQ9UQP3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TNNQ9UQP3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNNQ9UQP3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNNQ9UQP3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNNQ9UQP3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNNQ9UQP3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNNQ9UQP3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TNNQ9UQP3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TNNQ9UQP3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TNNQ9UQP3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TNNQ9UQP3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNNQ9UQP3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNNQ9UQP3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TNNQ9UQP3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TNNQ9UQP3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNNQ9UQP3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNNQ9UQP3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNNQ9UQP3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNNQ9UQP3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNNQ9UQP3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNNQ9UQP3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
TNNQ9UQP3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TNNQ9UQP3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNNQ9UQP3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNNQ9UQP3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNNQ9UQP3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
TNNQ9UQP3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNNQ9UQP3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNNQ9UQP3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNNQ9UQP3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNNQ9UQP3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNNQ9UQP3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNNQ9UQP3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNNQ9UQP3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNNQ9UQP3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNNQ9UQP3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNNQ9UQP3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TNNQ9UQP3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TNNQ9UQP3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TNNQ9UQP3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
TNNQ9UQP3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TNNQ9UQP3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNNQ9UQP3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNNQ9UQP3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNNQ9UQP3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNNQ9UQP3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNNQ9UQP3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
TNNQ9UQP3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNNQ9UQP3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TNNQ9UQP3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNNQ9UQP3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNNQ9UQP3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNNQ9UQP3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNNQ9UQP3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNNQ9UQP3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNNQ9UQP3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNNQ9UQP3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNNQ9UQP3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNNQ9UQP3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNNQ9UQP3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNNQ9UQP3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms