Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF19Q9UMS4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF19Q9UMS4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF19Q9UMS4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF19Q9UMS4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF19Q9UMS4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF19Q9UMS4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF19Q9UMS4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF19Q9UMS4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF19Q9UMS4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF19Q9UMS4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF19Q9UMS4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF19Q9UMS4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF19Q9UMS4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF19Q9UMS4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF19Q9UMS4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF19Q9UMS4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF19Q9UMS4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF19Q9UMS4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF19Q9UMS4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF19Q9UMS4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF19Q9UMS4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF19Q9UMS4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF19Q9UMS4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF19Q9UMS4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF19Q9UMS4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF19Q9UMS4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF19Q9UMS4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPF19Q9UMS4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPF19Q9UMS4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPF19Q9UMS4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF19Q9UMS4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF19Q9UMS4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF19Q9UMS4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF19Q9UMS4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF19Q9UMS4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF19Q9UMS4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF19Q9UMS4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF19Q9UMS4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF19Q9UMS4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF19Q9UMS4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF19Q9UMS4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF19Q9UMS4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF19Q9UMS4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF19Q9UMS4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRPF19Q9UMS4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF19Q9UMS4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF19Q9UMS4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF19Q9UMS4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF19Q9UMS4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF19Q9UMS4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF19Q9UMS4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF19Q9UMS4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF19Q9UMS4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF19Q9UMS4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF19Q9UMS4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF19Q9UMS4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF19Q9UMS4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF19Q9UMS4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF19Q9UMS4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRPF19Q9UMS4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF19Q9UMS4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms