Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF490Q9ULM2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF490Q9ULM2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF490Q9ULM2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF490Q9ULM2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF490Q9ULM2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF490Q9ULM2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF490Q9ULM2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF490Q9ULM2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF490Q9ULM2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF490Q9ULM2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF490Q9ULM2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF490Q9ULM2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF490Q9ULM2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF490Q9ULM2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF490Q9ULM2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF490Q9ULM2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF490Q9ULM2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF490Q9ULM2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF490Q9ULM2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF490Q9ULM2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF490Q9ULM2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF490Q9ULM2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF490Q9ULM2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF490Q9ULM2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF490Q9ULM2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF490Q9ULM2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF490Q9ULM2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF490Q9ULM2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF490Q9ULM2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF490Q9ULM2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF490Q9ULM2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF490Q9ULM2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF490Q9ULM2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF490Q9ULM2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF490Q9ULM2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF490Q9ULM2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF490Q9ULM2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF490Q9ULM2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF490Q9ULM2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF490Q9ULM2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF490Q9ULM2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF490Q9ULM2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF490Q9ULM2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF490Q9ULM2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF490Q9ULM2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF490Q9ULM2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF490Q9ULM2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF490Q9ULM2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF490Q9ULM2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZNF490Q9ULM2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF490Q9ULM2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF490Q9ULM2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF490Q9ULM2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF490Q9ULM2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF490Q9ULM2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF490Q9ULM2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF490Q9ULM2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF490Q9ULM2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF490Q9ULM2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF490Q9ULM2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF490Q9ULM2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF490Q9ULM2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF490Q9ULM2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF490Q9ULM2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF490Q9ULM2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF490Q9ULM2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF490Q9ULM2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF490Q9ULM2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF490Q9ULM2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF490Q9ULM2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF490Q9ULM2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF490Q9ULM2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF490Q9ULM2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF490Q9ULM2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF490Q9ULM2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF490Q9ULM2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF490Q9ULM2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms