Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF346Q9UL40 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF346Q9UL40 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF346Q9UL40 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF346Q9UL40 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF346Q9UL40 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF346Q9UL40 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF346Q9UL40 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF346Q9UL40 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF346Q9UL40 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF346Q9UL40 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF346Q9UL40 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF346Q9UL40 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF346Q9UL40 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF346Q9UL40 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF346Q9UL40 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF346Q9UL40 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF346Q9UL40 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF346Q9UL40 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF346Q9UL40 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF346Q9UL40 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF346Q9UL40 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF346Q9UL40 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF346Q9UL40 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF346Q9UL40 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF346Q9UL40 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF346Q9UL40 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF346Q9UL40 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF346Q9UL40 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF346Q9UL40 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF346Q9UL40 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF346Q9UL40 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF346Q9UL40 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF346Q9UL40 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF346Q9UL40 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF346Q9UL40 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF346Q9UL40 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF346Q9UL40 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF346Q9UL40 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF346Q9UL40 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF346Q9UL40 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF346Q9UL40 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF346Q9UL40 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF346Q9UL40 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF346Q9UL40 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF346Q9UL40 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF346Q9UL40 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF346Q9UL40 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF346Q9UL40 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF346Q9UL40 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF346Q9UL40 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF346Q9UL40 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF346Q9UL40 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF346Q9UL40 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF346Q9UL40 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF346Q9UL40 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF346Q9UL40 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF346Q9UL40 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF346Q9UL40 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF346Q9UL40 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF346Q9UL40 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF346Q9UL40 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF346Q9UL40 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF346Q9UL40 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF346Q9UL40 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF346Q9UL40 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF346Q9UL40 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF346Q9UL40 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF346Q9UL40 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF346Q9UL40 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF346Q9UL40 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF346Q9UL40 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF346Q9UL40 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF346Q9UL40 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF346Q9UL40 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF346Q9UL40 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF346Q9UL40 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF346Q9UL40 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF346Q9UL40 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF346Q9UL40 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF346Q9UL40 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF346Q9UL40 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF346Q9UL40 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF346Q9UL40 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms